RESUMO Objetivo: As micobactérias não tuberculosas (MNT) são um grupo heterogêneo de bactérias amplamente distribuídas na natureza e relacionadas com infecções oportunistas em seres humanos. Os objetivos deste estudo foram identificar MNT em pacientes com suspeita de tuberculose e culturas positivas e avaliar a diversidade genética de cepas identificadas como Mycobacterium avium. Métodos: Foram estudadas amostras pulmonares e extrapulmonares provenientes de 1.248 pacientes. As amostras que apresentaram resultado positivo em cultura e negativo para o complexo M. tuberculosis na identificação molecular foram avaliadas por meio da detecção dos genes hsp65 e rpoB e de sequenciamento de fragmentos conservados desses genes. Todas as cepas identificadas como M. avium foram genotipadas pelo método mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem-repeat com oito loci. Resultados: Das 332 micobactérias isoladas, 25 (7,5%) eram MNT. Dessas 25, 18 (72%) eram M. avium, 5 (20%) eram M. abscessus, 1 (4%) era M. gastri e 1 (4%) era M. kansasii. As 18 cepas de M. avium apresentaram alta diversidade, e apenas duas eram geneticamente relacionadas. Conclusões: Esses resultados mostram a necessidade de considerar a investigação de MNT em pacientes com suspeita de tuberculose ativa e culturas positivas e de avaliar a diversidade genética de cepas de M. avium.

ABSTRACT Objective: Nontuberculous mycobacteria (NTM) are a heterogeneous group of bacteria that are widely distributed in nature and associated with opportunistic infections in humans. The aims of this study were to identify NTM in patients with suspected tuberculosis who presented positive cultures and to evaluate the genetic diversity of strains identified as Mycobacterium avium. Methods: We studied pulmonary and extrapulmonary samples obtained from 1,248 patients. The samples that tested positive on culture and negative for the M. tuberculosis complex by molecular identification techniques were evaluated by detection of the hsp65 and rpoB genes and sequencing of conserved fragments of these genes. All strains identified as M. avium were genotyped using the eight-locus mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem-repeat method. Results: We found that NTM accounted for 25 (7.5%) of the 332 mycobacteria isolated. Of those 25, 18 (72%) were M. avium, 5 (20%) were M. abscessus, 1 (4%) was M. gastri, and 1 (4%) was M. kansasii. The 18 M. avium strains showed high diversity, only two strains being genetically related. Conclusions: These results highlight the need to consider the investigation of NTM in patients with suspected active tuberculosis who present with positive cultures, as well as to evaluate the genetic diversity of M. avium strains.

Polymorphisms in genes that encode chemokines or their receptors can modulate susceptibility to human immunodeficiency virus (HIV) infection and disease progression. The objective of this study was to assess the frequency of polymorphisms CCR5-Δ32, CCR2-64I, CCR5-59029A and SDF1-3'A and their role in the course of HIV infection in a Southern Brazilian population. Clinical data were obtained from 249 patients for an average period of 6.4 years and genotypes were determined by standard polymerase chain reaction (PCR) and PCR-restriction fragment length polymorphism. Survival analyses were conducted for three outcomes: CD4+ T-cell counts below 200 cells/µL, acquired immune deficiency syndrome (AIDS) or death. The frequency of the polymorphisms CCR5-Δ32, CCR2-64I, CCR5-59029A and SDF1-3'A were 0.024, 0.113, 0.487 and 0.207, respectively. CCR5-Δ32 was associated with a reduction in the risk for CD4+ T-cell depletion and with an increased risk for death after AIDS diagnosis. CCR2-64I was associated with a reduction in the risk for developing AIDS. SDF1-3'A was also associated with decreased risk for AIDS, but its effect was only evident when CCR2-64I was present as well. These results highlight the possibility of using these markers as indicators for the prognosis of disease progression and provide evidence for the importance of analysing the effects of gene polymorphisms in a combined fashion.

O objetivo deste estudo foi avaliar a prevalência de lesões bucais entre pacientes HIV positivos e identificar fatores associados a tais lesões. Foi realizado estudo transversal que coletou dados mediante entrevista, exame clínico e consulta aos prontuários médicos de pacientes adultos atendidos no Serviço de HIV-AIDS do Hospital Universitário da Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brasil, sendo considerados fatores sócio-demográficos, imunológicos e terapêuticos. Foi utilizada a regressão de Poisson num modelo hierárquico de análise. Entre abril de 2006 a janeiro de 2007 foram observados 300 pacientes, sendo 51% do sexo masculino e média de idade de 40 anos; 39% apresentaram lesões bucais, sendo a candidíase a mais freqüente (59,1%), seguida de leucoplasia pilosa (19,5%). As mulheres apresentaram um risco menor, com observância de uma associação inversa com o CD4. Houve um risco maior entre aqueles pacientes com menor escolaridade, menor renda, tabagistas, dependentes do álcool, com maior tempo de infecção pelo HIV e carga viral mais elevada. Os dados confirmaram a elevada prevalência das manifestações bucais oportunistas e evidenciaram a sua relação com a situação social, assim como sua relação com determinados hábitos e costumes passíveis de modificação.

The aim of the study was to assess the prevalence of oral lesions in AIDS patients and identify associated factors. A cross-sectional study collected data from interviews, clinical examination, and a review of medical records for adult patients treated at the HIV/AIDS clinic in the University Hospital of the Federal University in Rio Grande, Rio Grande do Sul State, Brazil, focusing on socio-demographic, immune status, and treatment factors. Poisson regression was used in a hierarchical analytical model. From April 2006 to January 2007, 300 patients were observed (51% males; mean age 40 years). Of the total, 39% presented oral lesions, with candidiasis as the most frequent (59.1%), followed by hairy leukoplakia (19.5%). Women showed a lower risk of oral lesions, and there was an inverse association with CD4 count. Increased risk was associated with lower schooling, low income, smoking, alcohol addiction, time since HIV seroconversion, and higher viral load. The data confirm the increased prevalence of opportunistic oral lesions and show their relationship to socioeconomic conditions and modifiable habits and customs.

O objetivo deste estudo foi avaliar a prevalência de lesões bucais entre pacientes HIV positivos e identificar fatores associados a tais lesões. Foi realizado estudo transversal que coletou dados mediante entrevista, exame clínico e consulta aos prontuários médicos de pacientes adultos atendidos no Serviço de HIV-AIDS do Hospital Universitário da Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brasil, sendo considerados fatores sócio-demográficos, imunológicos e terapêuticos. Foi utilizada a regressão de Poisson num modelo hierárquico de análise. Entre abril de 2006 a janeiro de 2007 foram observados 300 pacientes, sendo 51% do sexo masculino e média de idade de 40 anos; 39% apresentaram lesões bucais, sendo a candidíase a mais freqüente (59,1%), seguida de leucoplasia pilosa (19,5%). As mulheres apresentaram um risco menor, com observância de uma associação inversa com o CD4. Houve um risco maior entre aqueles pacientes com menor escolaridade, menor renda, tabagistas, dependentes do álcool, com maior tempo de infecção pelo HIV e carga viral mais elevada. Os dados confirmaram a elevada prevalência das manifestações bucais oportunistas e evidenciaram a sua relação com a situação social, assim como sua relação com determinados hábitos e costumes passíveis de modificação.

The aim of the study was to assess the prevalence of oral lesions in AIDS patients and identify associated factors. A cross-sectional study collected data from interviews, clinical examination, and a review of medical records for adult patients treated at the HIV/AIDS clinic in the University Hospital of the Federal University in Rio Grande, Rio Grande do Sul State, Brazil, focusing on socio-demographic, immune status, and treatment factors. Poisson regression was used in a hierarchical analytical model. From April 2006 to January 2007, 300 patients were observed (51% males; mean age 40 years). Of the total, 39% presented oral lesions, with candidiasis as the most frequent (59.1%), followed by hairy leukoplakia (19.5%). Women showed a lower risk of oral lesions, and there was an inverse association with CD4 count. Increased risk was associated with lower schooling, low income, smoking, alcohol addiction, time since HIV seroconversion, and higher viral load. The data confirm the increased prevalence of opportunistic oral lesions and show their relationship to socioeconomic conditions and modifiable habits and customs.

Diferentes subtipos do virus da imunodeficiência humana do tipo 1 (HIV-1) podem ter propriedades biológicas, imunológicas e patogênicas distintas. A eficiência da transmissão materno-infantil (TMI) pode estar entre estas propriedades, porém resultados escassos e controversos foram descritos até o momento. Neste estudo, 102 crianças nascidas de mães infectadas pelo HIV-1 entre 1998 e 2004 na cidade do Rio Grande, Brasil, foram analisadas para fatores de risco potenciais associados à TMI. Aquela região geográfica é caracterizada por uma alta proporção de indivíduos infectados pelo subtipo C do HIV-1, permitindo a comparação entre os subtipos B e C e sua influência na transmissão vertical do vírus. A análise também incluiu parâmetros clínicos, obstétricos e imunológicos. Análises de regressão multivariada foram conduzidas para avaliar a influência daqueles parâmetros na TMI, e as razões de prevalência (RP) e intervalos de confiança de 95% (IC95) foram também calculados. Um prevalência surpreendentemente alta do subtipo C acima dos 70% foi encontrada. Somente a carga viral do HIV e o uso de protocolo ACGT 076 maternos forma preditivos de TMI. O subtipo do HIV-1 e a contagem de células T CD4+ não foram associados a um risco aumentado de transmissão. Embora uma clara expansão do subtipo C seja evidente no sul do Brasil, esta não parece estar correlacionada com risco aumentado de transmissão vertical.

Different human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) subtypes may have distinct biological, immunological and pathogenic properties. Efficiency of mother-to-child transmission (MTCT) may be among those properties, but few and controversial results have been described so far. In this study, 102 children born from HIV-1-infected mothers between 1998 and 2004 in the city of Rio Grande, Brazil were analyzed for potential risk factors associated with MTCT. That geographic region is characterized by a high proportion of subtype C-infected subjects, and it allowed comparison between subtypes B and C and their influence on MTCT. The analysis also included clinical, obstetric and immunological parameters. Multivariate regression analyses were conducted to evaluate the influence of the parameters on MTCT, and prevalence ratios (PR) and 95% confidence intervals (CI95) were also calculated. A surprisingly high prevalence of subtype C of over 70% was found. Only the HIV viral load and the use of ACTG 076 protocol were predictive of MTCT. HIV subtype and CD4 T-cell counts were not associated with increased risk of transmission. Although a clear expansion of subtype C is evident in southern Brazil, it does not seem to correlate with increased risk of vertical transmission.

OBJETIVO: Considerando a relevância da co-infecção vírus da imunodeficiência humana/tuberculose, este estudo foi desenvolvido para determinar a prevalência e os fatores associados à tuberculose em pacientes residentes em uma zona de alta prevalência das duas infecções. MÉTODOS: Todos os pacientes atendidos no ano de 1999 no Serviço HIV/AIDS do Hospital Universitário da Universidade Federal do Rio Grande foram avaliados retrospectivamente desde o momento do diagnóstico da presença do vírus da imunodeficiência humana, em relação à ocorrência de tuberculose e sua associação com fatores sociodemográficos, comportamentais e imunológicos. RESULTADOS: A amostra incluiu 204 pacientes e a prevalência encontrada de tuberculose foi de 27%. A análise multivariada mostrou que existe uma associação significativa do desenvolvimento de tuberculose com a raça negra (razão de chance: 4,76; intervalo de confiança de 95%: 1,93 -11,72) e uma relação inversa com a contagem de linfócitos TCD4+ no momento do diagnóstico do vírus da imunodeficiência humana (razão de chance: 0,995; intervalo de confiança de 95%: 0,993-0,997). O sexo masculino (razão de chance: 2,49; intervalo de confiança de 95%: 1,15-5,39) e o uso de drogas (razão de chance: 2,1; intervalo de confiança: 95% de 1,02-4,31) podem também ser fatores de risco quando analisados separadamente. CONCLUSÃO: Os fatores responsáveis pelo desenvolvimento da tuberculose entre os pacientes soropositivos para o vírus da imunodeficiência humana incluem os aspectos imunitários e fatores socioeconômicos e demográficos. A alta taxa de tuberculose em pacientes soropositivos torna urgente implementar estratégias que combinem rápida identificação e tratamento dos casos, comunicantes e indivíduos com infecção latente.

OBJECTIVE: In view of the relevance of co-infection with tuberculosis and human immunodeficiency virus, this study was designed to determine tuberculosis prevalence and identify factors related to tuberculosis in patients residing in a region in which both infections are highly prevalent. METHODS: All patients treated during 1999 at the HIV/AIDS Clinic of the Universidade Federal do Rio Grande (Rio Grande Federal University) University Hospital were evaluated retrospectively, from the time of human immunodeficiency virus diagnosis, in terms of the incidence of tuberculosis and its relationship to sociodemographic, behavioral and immunological factors. RESULTS: The sample included 204 patients, and tuberculosis prevalence was found to be 27%. The multivariate analysis showed a significant correlation between the development of tuberculosis and being of African descent (odds ratio: 4.76; 95% confidence interval: 1.93-11.72) and an inverse correlation between the development of tuberculosis and the TCD4+ lymphocyte count at the time of human immunodeficiency virus diagnosis (odds ratio: 0.995; 95% confidence interval: 0.993-0.997). When analyzed separately, other variables were found to be potential risk factors: being of the male gender (odds ratio: 2.49; 95% confidence interval: 1.15-5.39); and using illicit drugs (odds ratio: 2.1; 95% confidence interval: 1.02-4.31). CONCLUSION: The factors responsible for the development of tuberculosis among patients who are human immunodeficiency virus seropositive include immunological, socioeconomic and demographic factors. The high rate of tuberculosis prevalence among the seropositive patients underscores the urgent need to implement strategies that combine rapid identification and prompt treatment of individuals with active or latent infection, as well as of those with whom they have been in contact.

Um estudo de epidemiologia molecular foi conduzido para investigar subtipos de HIV-1 circulando em Rio Grande, RS, buscando uma associação com modos de transmissão e comportamentos de risco. Pacientes (185) identificados de 1994 a 1997, em um Hospital de referência para o tratamento da AIDS foram incluidos; amostras de sangue foram obtidas de 107. A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi realizada uma única vez; nas amostras que amplificaram, (69) o subtipo foi classificado pelo ensaio de mobilidade do heteroduplex (HMA). Os subtipos de HIV identificados foram B (75%), C (22%) e F (3%). As infecções com C foram diagnosticadas após 1994. Pacientes infectados com B e C não mostraram diferenças (características demográficas, clínicas e laboratoriais); a análise de sobrevida não mostrou diferenças na evolução HIV-AIDS. Maior proporção de usuários de drogas injetáveis (UDI) (não significativa, p<0,07), foi identificada entre infectados com C. Este resultado sugere C ter sido introduzido nesta área através dos UDI, sendo transmitido pelos seus parceiros sexuais, a pessoas com outras práticas de risco.

We conducted a molecular epidemiological study to investigate HIV-1 strains in Rio Grande, southern Brazil, searching for an association with transmission mode and risk behavior. Patients (185) identified at an AIDS treatment reference Hospital, from 1994 to 1997, were included; from which 107 blood samples were obtained. Nested PCR was realized once for each sample; for amplified samples (69) HIV subtypes were classified using the heteroduplex mobility assay. Subtypes identified were B (75%), C (22%) and F (3%). All infections with C were diagnosed after 1994. Comparing patients with B and C, no differences were detected regarding demographic, clinical and laboratory characteristics; survival analysis did not reveal differences in HIV to AIDS evolution. A higher proportion of injecting drug users, IDU (not significant, p<.07) was found among those with C. This suggests that C may have been introduced in this area through IDU, and is being spread, probably by their sexual partners, to persons with other risk practices.